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本帖最后由 zhousht 于 2020-7-4 20:09 编辑
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COVID-19的来源:卡尔加里大学的研究表明,SARS-CoV-2自2013年以来缓慢发展' T, w" T4 m% E) R
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加拿大卡尔加里大学的科学家表示,至少从2013年以来,新型冠状病毒(SARS-CoV-2)可能已在人类中传播,尽管与造成现在大流行的病毒变种不同。
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; @5 ]5 F9 ?. w尽管科学家们一直在研究病毒基因组以寻找更多信息,但有人建议该病毒从一种动物跃入人类。尽管研究指出它的起源是自然的而不是人为的,但也有一些关于在实验室中制造它的理论。上个月,WHO通过了一项决议,调查该病毒的起源。
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现在,加拿大卡尔加里大学的一组科学家说,造成COVID-19的病毒(SARS-CoV-2)至少从2013年开始就已经在人群中传播,尽管与引起这种情况的变种与当前的大流行变种不同。
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! c8 |3 R! }' r! O3 B2 o) |5 g该研究的结果目前可在预印本服务器Biorxiv中使用,并且该研究尚未经过同行评审。
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本文还探讨了SARS-CoV-2的可能起源以及ACE-2受体在病毒的感染性(感染能力)中起着多大作用。
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病毒进化的过程
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# D" P2 t- ^& Q8 A6 Y& \" x为了能够生存,病毒会随着其宿主生物不断发展。当病毒跳跃宿主时,通常会出现一种新的病毒病原体,例如从动物到人类。因此,即使该病毒在原始动物宿主中引起轻度疾病或没有引起疾病,它在人类中也可能是高度传染性/高毒性的。就冠状病毒而言,已经发现病毒生活在蝙蝠内部而不会对蝙蝠造成太大损害,因为蝙蝠的免疫系统已经进化,可以控制病毒。但是人类却并非如此。结果,人类感染病毒容易生病。9 G R- @. W: z7 j
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研究发现( _ P/ t/ I. G
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该研究检查了SARS-CoV-2刺突蛋白的当前变体,以及它与人类ACE-2受体(hACE-2)结合的强度。新冠病毒的突突蛋白与人体细胞上的ACE-2受体之间的结合是帮助病毒进入健康细胞的原因。
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在这项研究中,卡尔加里大学的研究人员调查了2019年12月30日至2020年3月20日之间收集的约479种新型冠状病毒基因组序列,以了解其系统发育-这意味着该病毒的进化发展 ,以及与其他关系密切病毒的关系。1 ^+ W$ j6 Q7 m# h2 ~
7 K3 g' l# W7 S C! t: N8 W在所有基因组中,研究人员发现感染率超过5%的病毒约有16种变异和大约11种错义突变(其中一个核苷酸的变化使DNA / RNA编码不同的蛋白质),每种感染都有自己的系统发育树。7 o- T/ f$ Q3 y# \
+ b: W& {( Y8 ^3 F7 W9 K) u. j @他们的另一项初步发现是与蝙蝠和穿山甲冠状病毒的相似性。已发现SARS-CoV-2的基因组与蝙蝠冠状病毒RaTG13至少有96%的相似性,与穿山甲冠状病毒(Pangolin-CoV)至少有90%的相似性。以前曾有人提出,当前的病毒是这两种病毒的组合,是由于宿主中的共同感染而产生的。$ J) e9 G9 f2 {1 @
/ R8 }7 D- {# |6 J Q- w0 i. S为了研究起源,研究人员试图创建SARS-CoV-2突突蛋白受体结合域的遗传序列。受体结合结构域是刺突蛋白中实际上识别并与ACE-2受体结合的部分。他们为所有SARS-COV-2病毒创建了一个共同的遗传RBD序列,并将其标记为N1,并用最接近的动物病毒的变种标记为N0(N-零)。
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他们的发现:
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9 j1 V; P! D+ p1 i; w( J0 zN1序列与SARS-CoV-2病毒的参考序列相同,正如所预期的那样,而N0序列是唯一的,指向病毒的独特来源。$ g3 C; W. G1 q B1 a! ], A( |8 k
两个RNA / DNA序列仅在四个位置不同。
$ O% j) C) g! N1 h# v# i祖先的序列产生了各种后代,而RaTG13是SARS-COV-2病毒的近亲之一。由于RaTG13是在2013年左右发现的,因此引起病毒的COVID-19的原始祖先一定也在那时。
, J5 a( W9 l1 H! k* Y5 r( e5 Y) ]有趣的是,该病毒的早期变体与hACE2的结合远比最近的变体强。
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结论:
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' O3 x) q8 _1 v' h& T" T研究表明,SARS-CoV-2的结合亲和力可能不是其传染性的决定因素。肯定还有其他变化导致病毒对人类的感染性增加。同样,该病毒的祖先可能已经感染了人类一段时间,但症状较少。
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